Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB3O43889 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB3O43889 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB3O43889 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB3O43889 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB3O43889 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB3O43889 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB3O43889 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB3O43889 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB3O43889 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB3O43889 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB3O43889 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB3O43889 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB3O43889 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB3O43889 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB3O43889 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB3O43889 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB3O43889 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB3O43889 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB3O43889 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB3O43889 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB3O43889 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB3O43889 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB3O43889 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB3O43889 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB3O43889 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB3O43889 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB3O43889 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CREB3O43889 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB3O43889 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB3O43889 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB3O43889 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB3O43889 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB3O43889 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB3O43889 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB3O43889 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB3O43889 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB3O43889 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB3O43889 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB3O43889 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB3O43889 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB3O43889 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB3O43889 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB3O43889 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB3O43889 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB3O43889 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB3O43889 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB3O43889 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB3O43889 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB3O43889 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB3O43889 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB3O43889 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB3O43889 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB3O43889 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB3O43889 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB3O43889 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB3O43889 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB3O43889 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB3O43889 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB3O43889 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB3O43889 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB3O43889 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB3O43889 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB3O43889 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB3O43889 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB3O43889 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB3O43889 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB3O43889 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB3O43889 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB3O43889 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB3O43889 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB3O43889 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB3O43889 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB3O43889 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB3O43889 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB3O43889 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB3O43889 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB3O43889 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB3O43889 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB3O43889 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB3O43889 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB3O43889 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB3O43889 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB3O43889 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB3O43889 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB3O43889 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB3O43889 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB3O43889 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB3O43889 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB3O43889 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB3O43889 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB3O43889 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB3O43889 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB3O43889 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB3O43889 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB3O43889 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB3O43889 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB3O43889 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB3O43889 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB3O43889 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms