Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APAF1O14727 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APAF1O14727 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APAF1O14727 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
APAF1O14727 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APAF1O14727 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APAF1O14727 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APAF1O14727 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APAF1O14727 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APAF1O14727 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APAF1O14727 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APAF1O14727 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APAF1O14727 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APAF1O14727 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
APAF1O14727 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APAF1O14727 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APAF1O14727 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APAF1O14727 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APAF1O14727 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
APAF1O14727 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APAF1O14727 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APAF1O14727 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APAF1O14727 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APAF1O14727 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APAF1O14727 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APAF1O14727 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APAF1O14727 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APAF1O14727 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
APAF1O14727 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
APAF1O14727 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APAF1O14727 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
APAF1O14727 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APAF1O14727 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APAF1O14727 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APAF1O14727 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APAF1O14727 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APAF1O14727 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APAF1O14727 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APAF1O14727 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APAF1O14727 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
APAF1O14727 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APAF1O14727 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APAF1O14727 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
APAF1O14727 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
APAF1O14727 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APAF1O14727 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APAF1O14727 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APAF1O14727 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APAF1O14727 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APAF1O14727 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APAF1O14727 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APAF1O14727 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
APAF1O14727 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APAF1O14727 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APAF1O14727 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APAF1O14727 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APAF1O14727 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APAF1O14727 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APAF1O14727 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APAF1O14727 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APAF1O14727 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APAF1O14727 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APAF1O14727 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APAF1O14727 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APAF1O14727 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APAF1O14727 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APAF1O14727 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
APAF1O14727 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
APAF1O14727 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APAF1O14727 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
APAF1O14727 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APAF1O14727 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
APAF1O14727 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APAF1O14727 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APAF1O14727 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APAF1O14727 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APAF1O14727 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APAF1O14727 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APAF1O14727 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APAF1O14727 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APAF1O14727 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APAF1O14727 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APAF1O14727 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APAF1O14727 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APAF1O14727 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APAF1O14727 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APAF1O14727 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
APAF1O14727 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APAF1O14727 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APAF1O14727 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APAF1O14727 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APAF1O14727 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APAF1O14727 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APAF1O14727 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APAF1O14727 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APAF1O14727 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APAF1O14727 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
APAF1O14727 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APAF1O14727 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APAF1O14727 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms