Protein–RNA interactions for Protein: O00472

ELL2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL2O00472 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ELL2O00472 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELL2O00472 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELL2O00472 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELL2O00472 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELL2O00472 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELL2O00472 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELL2O00472 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELL2O00472 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELL2O00472 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELL2O00472 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELL2O00472 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ELL2O00472 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELL2O00472 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELL2O00472 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELL2O00472 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELL2O00472 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELL2O00472 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELL2O00472 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELL2O00472 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELL2O00472 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELL2O00472 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELL2O00472 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELL2O00472 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELL2O00472 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELL2O00472 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELL2O00472 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELL2O00472 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELL2O00472 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELL2O00472 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELL2O00472 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELL2O00472 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELL2O00472 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELL2O00472 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELL2O00472 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELL2O00472 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELL2O00472 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELL2O00472 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELL2O00472 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELL2O00472 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELL2O00472 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELL2O00472 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELL2O00472 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELL2O00472 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELL2O00472 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELL2O00472 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELL2O00472 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELL2O00472 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELL2O00472 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELL2O00472 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELL2O00472 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELL2O00472 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELL2O00472 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELL2O00472 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELL2O00472 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ELL2O00472 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELL2O00472 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELL2O00472 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELL2O00472 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELL2O00472 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELL2O00472 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELL2O00472 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELL2O00472 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELL2O00472 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELL2O00472 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELL2O00472 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELL2O00472 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELL2O00472 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELL2O00472 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELL2O00472 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELL2O00472 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELL2O00472 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELL2O00472 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELL2O00472 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELL2O00472 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELL2O00472 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELL2O00472 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ELL2O00472 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELL2O00472 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELL2O00472 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELL2O00472 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELL2O00472 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELL2O00472 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELL2O00472 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELL2O00472 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELL2O00472 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELL2O00472 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELL2O00472 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELL2O00472 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELL2O00472 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELL2O00472 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELL2O00472 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELL2O00472 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELL2O00472 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELL2O00472 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELL2O00472 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELL2O00472 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELL2O00472 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELL2O00472 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELL2O00472 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms