Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms