Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BHMG1C9JSJ3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms