Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ERVV-1B6SEH8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVV-1B6SEH8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms