Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00587B1AMM8 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms