Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms