Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC182A6NF36 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC182A6NF36 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms