Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC162PA2VCL2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC162PA2VCL2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC162PA2VCL2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC162PA2VCL2 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC162PA2VCL2 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC162PA2VCL2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC162PA2VCL2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC162PA2VCL2 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC162PA2VCL2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC162PA2VCL2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC162PA2VCL2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC162PA2VCL2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC162PA2VCL2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC162PA2VCL2 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC162PA2VCL2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC162PA2VCL2 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC162PA2VCL2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC162PA2VCL2 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC162PA2VCL2 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC162PA2VCL2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms