Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms