Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RCE1Q9Y256 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms