Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRTO4Q9UKD2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRTO4Q9UKD2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms