Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DKK4Q9UBT3 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms