Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
USP36Q9P275 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms