Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TBCCD1Q9NVR7 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms