Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FANCFQ9NPI8 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FANCFQ9NPI8 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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