Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CEP44Q9C0F1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP44Q9C0F1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms