Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B6

BRINP2, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP2Q9C0B6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRINP2Q9C0B6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms