Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIFKQ9BYG3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIFKQ9BYG3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIFKQ9BYG3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIFKQ9BYG3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIFKQ9BYG3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NIFKQ9BYG3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIFKQ9BYG3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIFKQ9BYG3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIFKQ9BYG3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIFKQ9BYG3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIFKQ9BYG3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIFKQ9BYG3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIFKQ9BYG3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIFKQ9BYG3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NIFKQ9BYG3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIFKQ9BYG3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIFKQ9BYG3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIFKQ9BYG3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIFKQ9BYG3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIFKQ9BYG3 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIFKQ9BYG3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NIFKQ9BYG3 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIFKQ9BYG3 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIFKQ9BYG3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIFKQ9BYG3 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIFKQ9BYG3 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NIFKQ9BYG3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIFKQ9BYG3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIFKQ9BYG3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIFKQ9BYG3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NIFKQ9BYG3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NIFKQ9BYG3 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms