Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRIP1Q9BX63 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
BRIP1Q9BX63 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms