Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIOK2Q9BVS4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms