Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
TREX2Q9BQ50 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX2Q9BQ50 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms