Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
JSRP1Q96MG2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms