Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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USP9XQ93008 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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USP9XQ93008 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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USP9XQ93008 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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USP9XQ93008 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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USP9XQ93008 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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USP9XQ93008 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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USP9XQ93008 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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USP9XQ93008 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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USP9XQ93008 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USP9XQ93008 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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