Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA4DQ92854 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms