Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms