Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC33Q8N5R6 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC33Q8N5R6 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC33Q8N5R6 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC33Q8N5R6 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC33Q8N5R6 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC33Q8N5R6 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC33Q8N5R6 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC33Q8N5R6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC33Q8N5R6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC33Q8N5R6 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC33Q8N5R6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC33Q8N5R6 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC33Q8N5R6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC33Q8N5R6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC33Q8N5R6 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC33Q8N5R6 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC33Q8N5R6 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC33Q8N5R6 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC33Q8N5R6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC33Q8N5R6 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC33Q8N5R6 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC33Q8N5R6 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC33Q8N5R6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC33Q8N5R6 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC33Q8N5R6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC33Q8N5R6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC33Q8N5R6 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC33Q8N5R6 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC33Q8N5R6 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC33Q8N5R6 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC33Q8N5R6 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC33Q8N5R6 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC33Q8N5R6 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC33Q8N5R6 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC33Q8N5R6 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC33Q8N5R6 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC33Q8N5R6 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC33Q8N5R6 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC33Q8N5R6 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC33Q8N5R6 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC33Q8N5R6 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC33Q8N5R6 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC33Q8N5R6 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC33Q8N5R6 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC33Q8N5R6 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC33Q8N5R6 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC33Q8N5R6 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC33Q8N5R6 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC33Q8N5R6 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC33Q8N5R6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms