Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BHLHA9Q7RTU4 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms