Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR52

ZNF493, Zinc finger protein 493, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF493Q6ZR52 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF493Q6ZR52 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF493Q6ZR52 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF493Q6ZR52 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF493Q6ZR52 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF493Q6ZR52 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF493Q6ZR52 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF493Q6ZR52 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF493Q6ZR52 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF493Q6ZR52 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF493Q6ZR52 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF493Q6ZR52 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF493Q6ZR52 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF493Q6ZR52 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF493Q6ZR52 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF493Q6ZR52 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF493Q6ZR52 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF493Q6ZR52 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF493Q6ZR52 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF493Q6ZR52 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF493Q6ZR52 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF493Q6ZR52 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF493Q6ZR52 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF493Q6ZR52 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF493Q6ZR52 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF493Q6ZR52 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF493Q6ZR52 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF493Q6ZR52 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF493Q6ZR52 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF493Q6ZR52 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF493Q6ZR52 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF493Q6ZR52 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF493Q6ZR52 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF493Q6ZR52 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF493Q6ZR52 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF493Q6ZR52 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF493Q6ZR52 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF493Q6ZR52 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF493Q6ZR52 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF493Q6ZR52 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF493Q6ZR52 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF493Q6ZR52 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ZNF493Q6ZR52 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ZNF493Q6ZR52 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms