Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM72Q6ZMU5 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM72Q6ZMU5 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM72Q6ZMU5 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM72Q6ZMU5 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM72Q6ZMU5 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM72Q6ZMU5 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM72Q6ZMU5 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM72Q6ZMU5 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM72Q6ZMU5 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms