Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NANOGP8Q6NSW7 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NANOGP8Q6NSW7 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms