Protein–RNA interactions for Protein: Q5XUX1

FBXW9, F-box/WD repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW9Q5XUX1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXW9Q5XUX1 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXW9Q5XUX1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXW9Q5XUX1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXW9Q5XUX1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXW9Q5XUX1 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXW9Q5XUX1 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXW9Q5XUX1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXW9Q5XUX1 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXW9Q5XUX1 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXW9Q5XUX1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXW9Q5XUX1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FBXW9Q5XUX1 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FBXW9Q5XUX1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FBXW9Q5XUX1 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FBXW9Q5XUX1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FBXW9Q5XUX1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FBXW9Q5XUX1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FBXW9Q5XUX1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FBXW9Q5XUX1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms