Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RNF123Q5XPI4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF123Q5XPI4 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms