Protein–RNA interactions for Protein: Q5U5Q3

MEX3C, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEX3CQ5U5Q3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEX3CQ5U5Q3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms