Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BRMS1LQ5PSV4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms