Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms