Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC38Q502W7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms