Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN3Q4LDR2 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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