Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY17

SLC25A52, Solute carrier family 25 member 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A52Q3SY17 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC25A52Q3SY17 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms