Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCK2Q16822 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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