Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMA3Q16787 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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