Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPE65Q16518 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPE65Q16518 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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