Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NTRK3Q16288 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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