Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
VAMP3Q15836 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
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