Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIP4Q15650 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIP4Q15650 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms