Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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UBE3CQ15386 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
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UBE3CQ15386 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBE3CQ15386 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
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UBE3CQ15386 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
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UBE3CQ15386 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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UBE3CQ15386 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
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UBE3CQ15386 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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UBE3CQ15386 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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UBE3CQ15386 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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UBE3CQ15386 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE3CQ15386 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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