Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IRF4Q15306 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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