Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PDCD1Q15116 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms