Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRD3Q15059 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRD3Q15059 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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